Биоинформатик (разработка пайплайнов для анализа NGS)

Институт синтетической биологии и генной инженерии ФГБУ "ЦСП" ФМБА России занимается прикладными научными исследованиями в области генетики и здоровья человека, разработки лекарств, вакцин, тест-систем, разработки информационных систем для науки. Команда Института — это эксперты в области биологических наук, медицины, биоинформатики, ИТ. Отдел эпигенетических методов исследования приглашает на работу Биоинформатика-разработчика. Стек технологий: Языки программирования: Python, Bash. Оркестрация пайплайнов: Apache Airflow. Биоинформатические пакеты: Biopython, R. Веб-фреймворк: Flask. Обязанности: Разработка, настройка и поддержка автоматизированных пайплайнов первичного анализа данных NGS. Создание и поддержка специализированных инструментов для биоинформатического анализа, в первую очередь для анализа структурных вариантов. Автоматизация рутинных процессов обработки данных. Интеграция и поддержка внутренних биоинформатических сервисов. Требования: Высшее техническое, математическое или биоинформатическое образование. Опыт программирования для создания инструментов обработки данных. Практические навыки владения указанным стеком технологий (Python, Bash, Airflow, Biopython, R, Flask). Вовлеченность в биоинформатику, понимание принципов работы с NGS-данными. Готовность к методической работе, составлению технической документации и служебных записок. Организационные требования: Гибридный формат работы 3 дня в офисе в г. Москва и 2 дня удаленно после прохождения испытательного срока. Полная занятость, пятидневная рабочая неделя. Будет плюсом: Опыт работы с системами HPC (вычислительными кластерами). Знание методов анализа структурных вариантов. Опыт контейнеризации приложений (Docker). Наличие открытых репозиториев на GitHub/GitLab.